Jedan od postupaka koji se sprovodi u cilju povećanja procenta uspešnosti vantelesne oplodnje je i inicijacija – aktivacija endometrijuma. To je proces namernog pravljenja defekata na sluzokoži materice što dovodi do njenog pravilnijeg formiranja u sledećem ciklusu.
Poželjno je da ova procedura bude urađena pre ciklusa kada je planirana vantelesna oplodnja, a radi se obično u lokalnoj anesteziji, ili bez nje, uz korišćenje specijalnih katetera koji putem vakuma usisavaju određeni deo sluzokože. U narednom ciklusu slede procesi stimulacije ovulacije, uzimanje ćelija, njihovo oplođenje i na kraju embriotransfer, sa daleko većim šansama za uspeh.
Kod inicijacije endometrijuma u spontanom ciklusu, redosled događaja je malo drugačiji, samim tim što se ne stimuliše ciklus. Cilj ove metode je prikupljanje dva ili tri embriona, njihovo zamrzavanje (vitrifikacija) i potom vraćanje nakon inicijacije endometrijuma nazad u matericu.
U ciklusu pre planiranog transfera, zajedno sa uzimanjem ćelije, vrši se aktivacija endometrijuma. Tom prilikom se prate hormoni pacijentkinje i ukoliko se ne produkuju u dovoljnoj količini da podrže usađivanje, terapijski se dodaju. Ova procedura dovodi do znatno većeg uspeha prirodnih IVF ciklusa.